癌癥是由腫瘤細(xì)胞的基因組改變引起的。

癌癥基因組的特點(diǎn)是廣泛的基因組重排以及點(diǎn)突變。體細(xì)胞構(gòu)造基因變異(SSV)，包含插進(jìn)損害，對(duì)癌證的分子結(jié)構(gòu)圖譜有重特大危害。盡管研究已經(jīng)確定了基因轉(zhuǎn)錄和SSV斷裂點(diǎn)之間的關(guān)聯(lián)模式，但尚不清楚結(jié)構(gòu)變異對(duì)DNA甲基化的影響。

近日，美國(guó)貝勒醫(yī)學(xué)院領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)表示，基因組結(jié)構(gòu)變異對(duì)DNA甲基化的影響很大，但是長(zhǎng)時(shí)間來并沒有得到重視。

研究人員收集了1400多例人類癌癥的全基因組測(cè)序、基因表達(dá)和DNA甲基化的數(shù)據(jù)。發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)變異改變了數(shù)百個(gè)基因的DNA甲基化水平，總的來說降低了癌癥的DNA甲基化水平。

研究人員表示：“當(dāng)DNA片段從基因組的一個(gè)區(qū)域轉(zhuǎn)移到另一個(gè)區(qū)域時(shí)，就會(huì)發(fā)生基因組結(jié)構(gòu)變異，這會(huì)顯示為序列上的斷裂點(diǎn)。因而，當(dāng)測(cè)序Dna精彩片段時(shí)，你將會(huì)會(huì)發(fā)覺來源于不一樣地域的2個(gè)Dna精彩片段結(jié)合在一起，進(jìn)而損壞了由Dna編號(hào)的遺傳基因命令?！?br />
在這項(xiàng)研究中，研究人員分析了兩個(gè)不同聯(lián)盟的數(shù)據(jù)，分別是癌癥基因組圖譜（Cancer?Genome?Atlas）和泛癌癥全基因組分析（PCAWG）。這種數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)包括全部基因組的分子式轉(zhuǎn)換，包括蛋白總數(shù)遺傳基因和調(diào)整區(qū)。

有那么多病人樣版，科學(xué)研究工作人員的剖析具備更強(qiáng)的統(tǒng)計(jì)分析能力，而且更非常容易尋找與癌證有關(guān)的新遺傳基因。

在開始的研究中，研究結(jié)果顯示，對(duì)于很大一部分的癌癥，基因組結(jié)構(gòu)變異在改變DNA甲基化上扮演重要角色。DNA甲基化是控制基因表達(dá)的一種方式，屬于表觀基因組（epigenome）的一部分。

在多種類型的癌癥中，甲基化的改變都以非隨機(jī)的方式發(fā)生。除開一些己知與癌證有關(guān)的基因，科學(xué)研究工作人員還評(píng)定了一些之前沒有有關(guān)的基因。一般來說，構(gòu)造基因變異與Dna甲基化的總體降低相關(guān)。

癌癥的表觀基因組發(fā)生了改變。通過目前這項(xiàng)研究，結(jié)構(gòu)變異是改變表觀基因組的重要機(jī)制之一。這一點(diǎn)是之前沒有被了解到。

在科學(xué)研究的第二部分，針對(duì)不一樣的癌證，構(gòu)造變異的總數(shù)都是不一樣的。有些癌癥的變異不太多，而有些癌癥則有著廣泛的結(jié)構(gòu)變異。這些結(jié)果使得科研人員能夠根據(jù)癌癥的結(jié)構(gòu)變異程度對(duì)癌癥進(jìn)行分層。

從某種意義上說，目前來說，這項(xiàng)研究是從未有過的，因?yàn)榘l(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)變異不僅引入了DNA序列的錯(cuò)誤，還在表觀遺傳水平上影響DNA?？茖W(xué)研究工作人員提議，在找尋癌癥的基因遺傳時(shí)，應(yīng)當(dāng)考慮到構(gòu)造變異對(duì)Dna甲基化的危害。

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