癌癥體細胞在突變后可以產(chǎn)生用于區(qū)分惡性細胞與正常細胞的新抗原(neoantigens)。然而，在腫瘤研究領(lǐng)域，如何在個體化層面鑒定這類新抗原和相關(guān)驗證仍然是一巨大挑戰(zhàn)。

據(jù)出國看病領(lǐng)導品牌厚樸方舟消息，近日，斯坦福大學(Stanford University)下屬的“新抗原鑒定管道”研究項目在外套細胞淋巴瘤(MCL)患者的人源白細胞抗原(HLA)Ⅱ類分子上發(fā)現(xiàn)了患者特異性的“獨特型(idiotypic)”免疫球蛋白肽。這一重大創(chuàng)新研究成果發(fā)表在了本周三《自然》雜志上。該論文通訊作者之一、斯坦福大學腫瘤學教授Ash A. Alizadeh博士認為，這一新抗原可有望開啟高效的個性化癌癥疫苗或T細胞治療方法方法方法。

▲研究人員整合基因組和蛋白質(zhì)組學策略來發(fā)現(xiàn)人類新抗原

研究人員通過使用整合的基因組和蛋白質(zhì)組學策略來發(fā)現(xiàn)人類外套細胞淋巴瘤中的新抗原，該研究管道線從每個患者收集了預處理腫瘤和非腫瘤組織樣品，然后使用質(zhì)譜法鑒定與所有HLA I類等位基因和腫瘤樣品的主要組織相容性復合物Ⅱ類DR(HLA-DR)相結(jié)合的多肽分子。然后，這些肽鏈與通過腫瘤和非腫瘤樣品的DNA測序鑒定的突變腫瘤表位進行了交叉參考于是獲得了一系列新抗原：也就是位于HLA分子上，呈遞給T細胞的突變表位。

較終，在17例MCL患者中，該方法鑒定出來自13個基因的全新抗原，它們?nèi)烤幋a免疫球蛋白重鏈可變區(qū)(Ighv)或免疫球蛋白輕鏈(IgLC)蛋白。所有的新抗原都呈現(xiàn)在靶向CD4+T細胞的HLA-DR上。

在來自其中一個患者的CD4+T細胞中，該患者的Ighv和IgLC新抗原的合成形式誘導了新抗原特異性的T細胞活化。在共培養(yǎng)物中，活化后的T細胞有效地殺死了患者的MCL細胞，但對那些不具有新抗原的患者正常B細胞幾乎沒有影響!

在第二個患者中，由新抗原和HLA-DR分子組成的四聚體在預處理血液樣品中鑒定了新抗原特異性的CD4+T細胞，并且顯示經(jīng)全細胞MCL疫苗和化療方案治療后，患者的兩大新生抗原特異性的T細胞群體有所擴增。

Ash Alizadeh博士評論說：“數(shù)據(jù)表明，研究中的每位患者都有免疫球蛋白抗原呈遞HLA Ⅱ類分子。如果我們在免疫球蛋白區(qū)域洞察某些序列特征，便可能省略質(zhì)譜分析，并推斷出抗原肽的存在。”接下來的研究步驟包括使用該方法鑒定其他癌癥患者中的新抗原，并采用該方法逐步發(fā)現(xiàn)其他HLA Ⅱ類等位基因。

▲研究人員預測設(shè)計腫瘤新抗原

這一重大研究發(fā)現(xiàn)顯示，綜合MHC分離、肽鑒定和外顯子測序的方法是一大揭示腫瘤新抗原的有效平臺。這種策略初步適用于人類淋巴瘤，并將免疫球蛋白新抗原發(fā)展作為個體化淋巴瘤免疫治療方法方法方法的靶標。

來源：藥明康德

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