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出國看病:細胞單獨測序為兒童腦瘤個體化治療奠定基礎
【本文為疾病百科知識,僅供閱讀】 2019-07-31 作者:厚樸方舟
髓母細胞瘤是兒童較常見的腦腫瘤之一,主要發(fā)生在小腦,惡性程度高,半數(shù)患者的發(fā)病年齡不足6歲。盡管從總體來說,通過手術(shù)、化療和放療等常用治療手段,目前髓母細胞瘤的5年生存率已經(jīng)達到75%~85%。但髓母細胞瘤有細分的不同亞型,各種亞型的預后差異非常不同,相應地也就需要采用不同的治療手段。
在權(quán)威學術(shù)期刊《自然》前沿上線的一篇論文中,針對一種在兒童中常見的惡性腦瘤——髓母細胞瘤,科學家們在個體化治療的方向上邁進重要一步。
美國圣猶大兒童研究醫(yī)院(St. Jude Children’s Research Hospital)與哈佛麻省總醫(yī)院(Massachusetts General Hospital)合作的研究團隊,利用單細胞組學分析,詳細描述了不同亞型髓母細胞瘤的細胞來源。研究機構(gòu)在其新聞稿中介紹,這是“迄今為止應用單細胞RNA測序?qū)λ枘讣毎鲞M行的較深入分析”,并且“有可能較終影響對這一疾病的臨床護理”。
過去人們按已知的分子特征把髓母細胞瘤分成4個亞型:WNT亞型、SHH亞型(分別由WNT、SHH基因信號通路的異常引起)、第3亞型和第4亞型。其中,第3亞型和第4亞型較常見,占了所有髓母細胞瘤的60%,卻是人們了解較少的,也是研究人員重點攻克的目標。
為此,科學家們?nèi)〉昧?5例患者手術(shù)切除的腫瘤樣本,以及用11例病人來源的腫瘤細胞做異種移植得到的動物模型,總共對將近9萬個細胞進行深度的單細胞RNA測序。不同于傳統(tǒng)的基因測序,轉(zhuǎn)錄組學分析讓科學家可以了解每個細胞中基因是如何被控制的,尤其是哪些基因的表達可以決定細胞的行為?!坝^察單個細胞的能力推動我們了解髓母細胞瘤的亞型如何產(chǎn)生,而我們?nèi)绾慰梢宰屩委煂颊吒行??!惫餐ㄓ嵶髡逷aul Northcott博士說。
▲對患者腫瘤樣本和異種移植動物模型獲得的樣本做單細胞RNA測序示意圖(圖片來源:參考資料[1])
在詳盡的分析之下,研究人員對過去所知甚少的第4亞型有了新的發(fā)現(xiàn),這類腫瘤很可能是起源于小腦中的單極刷細胞(unipolar brush cell)和產(chǎn)生谷氨酸的小腦核(cerebellar nuclei)。過去,對第4亞型的研究一直缺乏在基因?qū)用婵梢阅M疾病的實驗模型,而了解細胞來源無疑為開發(fā)準確的實驗模型打好基礎,對未來研究的重要性不言而喻。
▲髓母細胞瘤不同亞型與不同細胞類型的關(guān)聯(lián),第4亞型的來源與單極刷細胞(UBC)和谷氨酸能小腦核(GluCN)關(guān)聯(lián)程度高(圖片來源:參考資料[1])
對預后相對較差的第3亞型,研究結(jié)果雖然沒有直接提供準確的細胞來源,但一些新的解釋可以幫助研究人員更好地理解這一亞型。例如,或許還需要檢查小腦以外的組織。以及特異性原癌基因MYC對細胞的改變之大或許是難以識別來源的原因。
值得一提的是,根據(jù)基因表達特征的深入分析讓科學家對髓母細胞瘤的分型方式有了不同以往的發(fā)現(xiàn)?!八枘讣毎龅牡?亞型和第4亞型有很多混淆不清的地方,有些明顯屬于另一個分型,還有一些則同時顯示出兩個分型的特征,”這項研究的共同通訊作者之一Mario Suva博士說:“現(xiàn)在,我們可以更清楚地看到在第3亞型和第4亞型之間有一個中間群體?!毖芯咳藛T認為這一中間組的獨特生物學特性可能對未來臨床試驗的設計產(chǎn)生影響。
▲基因表達特征顯示,有共享第3亞型和第4亞型特征的中間型(圖片來源:參考資料[1])
對相對預后優(yōu)質(zhì)的WNT亞型,這項研究也提供了新的視角,表明基于基因表達譜,可以細分為四種不同的腫瘤細胞群。
此外,研究還確認SHH亞型腫瘤很可能起源于小腦顆粒神經(jīng)元的前體細胞。這一亞型在3歲以下的嬰幼兒和18歲以上的成人患者中常見,而對患者腫瘤細胞的來源分析揭示,在不同年齡的群體中,同為SHH腫瘤,細胞分化程度上有著顯著的差異。
綜合來看,這項前沿研究采用的分析手段為研究兒童腦瘤提供了比較好工具,分析結(jié)果使科學家們對髓母細胞瘤不同亞型的有了跟深入的認識。近9萬個細胞的單獨測序研究,為個體化治療兒童腦瘤奠定了基礎,有望在未來為每一個髓母細胞瘤患者帶來更合適的診斷和治療方案。
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